Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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TRAF1Q13077 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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TRAF1Q13077 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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TRAF1Q13077 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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TRAF1Q13077 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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TRAF1Q13077 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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TRAF1Q13077 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
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TRAF1Q13077 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
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TRAF1Q13077 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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TRAF1Q13077 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
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TRAF1Q13077 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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