Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 MAP3K19-206ENST00000392918 1460 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC095038.1-201ENST00000429248 1591 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 LINC01832-201ENST00000446520 553 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC026391.1-201ENST00000450677 537 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC020611.2-201ENST00000535594 671 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 PCED1B-AS1-202ENST00000547600 523 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 Z98949.1-213ENST00000608921 856 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 RNA5SP152-201ENST00000365184 110 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AL079341.1-201ENST00000404701 1207 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 LINC01771-201ENST00000445039 567 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC093895.1-201ENST00000506480 821 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 B3GNTL1P1-201ENST00000509174 289 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC022973.4-201ENST00000524100 917 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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