Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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PGGT1BP53609 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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PGGT1BP53609 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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PGGT1BP53609 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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