Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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HOXA13P31271 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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