Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 NAV2-216ENST00000540292 11003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 AP1G1-201ENST00000299980 6969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 DPY19L3-202ENST00000392250 5998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AL034345.2-202ENST00000416948 830 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 UFL1-201ENST00000369278 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 CLASP2-225ENST00000635664 4176 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
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