Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 BCAS2P1-201ENST00000528022 632 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms