Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LRRTM2O43300 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
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