Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 NR1I3-208ENST00000412844 989 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC021151.1-201ENST00000506933 183 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 MALAT1-203ENST00000544868 480 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC084030.1-202ENST00000413385 880 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms