Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 LINC01013-205ENST00000458028 1345 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 MARK2P4-201ENST00000503381 2380 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
MIS18AQ9NYP9 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.3 ms