Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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