Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC091167.5-201ENST00000605689 894 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 RBMY2AP-201ENST00000445405 1157 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 RBMY2CP-201ENST00000448575 1157 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 RBMY2DP-202ENST00000448881 1157 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms