Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 FGF10-201ENST00000264664 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 HYDIN-206ENST00000393567 15719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 RNF217-AS1-201ENST00000439075 4507 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 OR52I1-202ENST00000530443 2961 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
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VPS72Q15906 MYO1B-203ENST00000392316 4764 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
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VPS72Q15906 FREM2-201ENST00000280481 16070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
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VPS72Q15906 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
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VPS72Q15906 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 NRCAM-205ENST00000413765 6406 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 MFAP3L-203ENST00000393704 5827 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 ZNF257-203ENST00000594947 3874 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.61□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC7.61□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
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