Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AL133320.1-201ENST00000621423 2352 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 SLC24A1-209ENST00000537259 3983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 BRINP3-201ENST00000367462 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 PLEKHS1-202ENST00000361048 3249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 PLEKHS1-207ENST00000619563 3247 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 USPL1-203ENST00000614860 4074 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 UMAD1-206ENST00000636849 2157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 OR4Q3-202ENST00000642117 2165 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 NOX1-203ENST00000372964 661 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AL049697.3-201ENST00000406493 982 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 GEMIN2P2-201ENST00000418195 715 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AL445430.2-201ENST00000423149 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 RN7SL160P-201ENST00000468558 284 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 MAGEB18-201ENST00000325250 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 OR2A20P-201ENST00000479887 2913 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 ZNF214-201ENST00000278314 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 CCR9-201ENST00000355983 2653 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 CPNE4-202ENST00000502818 2120 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 SLC2A14-201ENST00000340749 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 FSTL5-203ENST00000427802 2920 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 KDM4C-205ENST00000428870 3039 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 PAH-201ENST00000307000 2466 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 TMEM217-201ENST00000336655 1546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AIM2-202ENST00000368130 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 DPCR1-201ENST00000304311 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 CASP8-203ENST00000323492 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 CTH-202ENST00000370938 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 OPALIN-204ENST00000419479 3581 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms