Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC022001.1-201ENST00000605193 268 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SS18Q15532 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 MRPL35-203ENST00000409180 651 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 LINC02218-202ENST00000504998 582 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SS18Q15532 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms