Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC243829.2-201ENST00000617914 470 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC006453.3-201ENST00000635891 377 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 HRG-201ENST00000232003 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 TTC33-207ENST00000637375 1824 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 NEK5-201ENST00000355568 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 CDY19P-201ENST00000411668 1613 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 CDY18P-201ENST00000438294 1609 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 LRFN5-203ENST00000554120 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 HSP90AA2P-201ENST00000530115 2196 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AL359263.1-201ENST00000441188 2796 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 TMEM31-201ENST00000319560 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 RNA5SP114-201ENST00000363780 113 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 OR2H1-204ENST00000396792 1294 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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PDCD1Q15116 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC019130.1-201ENST00000413841 391 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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PDCD1Q15116 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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PDCD1Q15116 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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PDCD1Q15116 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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PDCD1Q15116 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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PDCD1Q15116 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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PDCD1Q15116 ACTG1P15-201ENST00000570019 1063 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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PDCD1Q15116 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC026108.1-201ENST00000635444 547 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC093844.1-201ENST00000514910 1361 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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