Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 UTP15-201ENST00000296792 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 FAM186A-203ENST00000543096 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 TMEM269-204ENST00000637012 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AMPD1-203ENST00000520113 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 KLHL7-203ENST00000409689 3231 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 PTPRR-202ENST00000342084 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AL162456.1-201ENST00000634535 2006 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC126323.2-201ENST00000559985 2369 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 CASC6-201ENST00000437768 733 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 KLHL2-204ENST00000506761 2169 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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