Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC7.89□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135 ms