Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 MROH9-201ENST00000367758 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 GRAMD1B-207ENST00000529750 7723 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 MEF2C-210ENST00000506554 3469 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 MYO1B-203ENST00000392316 4764 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
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