Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC009303.1-201ENST00000426307 352 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 MIR181A1HG-202ENST00000432296 930 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AL451164.3-201ENST00000441377 447 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AF196972.1-201ENST00000445586 653 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC003035.2-201ENST00000448948 696 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 TREML3P-201ENST00000457327 501 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 RN7SL849P-201ENST00000485236 295 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC114940.1-201ENST00000512162 1265 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 DCAF13P2-201ENST00000514188 555 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AP001007.2-201ENST00000525429 593 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 IQCK-206ENST00000564186 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC026461.2-201ENST00000568608 244 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 MIR3159-201ENST00000584572 74 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
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FOXE3Q13461 AL596275.2-203ENST00000641951 371 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AL356361.1-201ENST00000400943 1459 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 SEC23IP-208ENST00000543134 1461 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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FOXE3Q13461 PDE11A-212ENST00000358450 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
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FOXE3Q13461 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
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FOXE3Q13461 LINC01968-202ENST00000423318 3647 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
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FOXE3Q13461 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 BTBD7-208ENST00000555525 2328 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AF064860.2-201ENST00000457325 1542 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 LINC01537-201ENST00000450804 2450 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 TMOD2-203ENST00000539962 3000 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 OR4D11-201ENST00000313253 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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