Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
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TRAF1Q13077 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
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TRAF1Q13077 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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TRAF1Q13077 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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TRAF1Q13077 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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TRAF1Q13077 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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TRAF1Q13077 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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TRAF1Q13077 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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TRAF1Q13077 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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TRAF1Q13077 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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TRAF1Q13077 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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