Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC016822.1-201ENST00000457975 439 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 LINC01098-201ENST00000507870 1034 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC091849.1-201ENST00000509920 121 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC139491.5-201ENST00000510029 920 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 KLRD1-209ENST00000543420 802 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC078864.1-201ENST00000547538 512 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 BUB1P1-201ENST00000603541 607 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 IGHV2-26-201ENST00000390611 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 E2F6P3-201ENST00000441743 743 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 RN7SL492P-201ENST00000460700 295 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC010442.1-201ENST00000515583 816 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 LINC02207-201ENST00000554530 1256 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AL132640.1-201ENST00000559594 619 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 RPS4XP21-201ENST00000603814 750 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 DAPL1-204ENST00000621326 671 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms