Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 PAGE2-201ENST00000374965 456 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 OR51B4-201ENST00000380224 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 AP001372.3-201ENST00000530510 609 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 AC010531.4-201ENST00000570286 576 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 ZNF677-211ENST00000601828 719 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 MRPL47-201ENST00000259038 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 SEC61G-201ENST00000352861 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 RPS4XP17-201ENST00000479057 754 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 LINC00640-204ENST00000557295 708 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 Z93930.3-201ENST00000607919 749 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 LINC00682-204ENST00000637677 931 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 CDY3P-201ENST00000454543 1618 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms