Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms