Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TMPOP42166 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TMPOP42166 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TMPOP42166 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TMPOP42166 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TMPOP42166 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
TMPOP42166 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
TMPOP42166 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TMPOP42166 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMPOP42166 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMPOP42166 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMPOP42166 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMPOP42166 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMPOP42166 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TMPOP42166 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMPOP42166 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMPOP42166 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TMPOP42166 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMPOP42166 SOX9-AS1-202ENST00000414600 742 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMPOP42166 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMPOP42166 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TMPOP42166 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMPOP42166 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMPOP42166 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TMPOP42166 PRELID3BP3-201ENST00000584963 545 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMPOP42166 ZFP42-201ENST00000326866 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMPOP42166 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMPOP42166 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMPOP42166 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMPOP42166 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TMPOP42166 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TMPOP42166 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TMPOP42166 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TMPOP42166 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TMPOP42166 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TMPOP42166 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TMPOP42166 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TMPOP42166 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TMPOP42166 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TMPOP42166 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TMPOP42166 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TMPOP42166 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TMPOP42166 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TMPOP42166 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TMPOP42166 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TMPOP42166 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TMPOP42166 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TMPOP42166 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TMPOP42166 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TMPOP42166 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TMPOP42166 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TMPOP42166 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TMPOP42166 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TMPOP42166 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TMPOP42166 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TMPOP42166 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TMPOP42166 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TMPOP42166 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TMPOP42166 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TMPOP42166 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TMPOP42166 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TMPOP42166 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TMPOP42166 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TMPOP42166 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TMPOP42166 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TMPOP42166 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TMPOP42166 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TMPOP42166 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TMPOP42166 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TMPOP42166 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TMPOP42166 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TMPOP42166 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TMPOP42166 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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