Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 AC119044.1-202ENST00000548463 339 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 GCNT3-201ENST00000396065 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 CELF2-203ENST00000416382 6894 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 SPEF2-211ENST00000509059 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 AL512624.2-201ENST00000621705 2566 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 OR51B4-201ENST00000380224 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 AC024451.1-201ENST00000508013 779 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 DDX24-209ENST00000621632 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 ATP2B4-201ENST00000341360 4658 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 ZNF451-204ENST00000370708 9478 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 CCDC162P-202ENST00000368966 6751 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 MR1-204ENST00000367580 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 ZNF793-201ENST00000445217 6712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 GSTCD-201ENST00000360505 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
POLR2AP24928 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms