Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC106798.1-202ENST00000506819 589 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC114947.1-201ENST00000511991 432 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AP003438.1-201ENST00000518704 435 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC008691.1-202ENST00000521472 811 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC021242.2-202ENST00000522129 545 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 ANAPC15-211ENST00000542531 812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL049844.1-201ENST00000545614 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 FLVCR2-204ENST00000553587 584 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 TRIM69-204ENST00000558329 1211 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC092720.1-203ENST00000563921 550 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC007255.2-201ENST00000604053 631 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC113361.1-201ENST00000606683 543 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 Metazoa_SRP.189-201ENST00000614219 303 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC068234.2-201ENST00000619646 522 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 PART1_3.1-201ENST00000619680 131 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AP005212.3-201ENST00000619964 528 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 Six3os1_1.1-201ENST00000620900 87 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC025287.2-201ENST00000621911 668 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 EDRF1-AS1-214ENST00000622798 526 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 PHF11-201ENST00000357596 1471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 CDY19P-201ENST00000411668 1613 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 CDY18P-201ENST00000438294 1609 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 TTR-201ENST00000237014 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RAET1G-201ENST00000367360 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RN7SKP148-201ENST00000410179 275 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC006013.1-201ENST00000424888 758 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 CHCHD3P1-201ENST00000425516 676 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 SDHC-204ENST00000432287 460 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms