Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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CHPF2Q9P2E5 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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CHPF2Q9P2E5 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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CHPF2Q9P2E5 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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CHPF2Q9P2E5 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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CHPF2Q9P2E5 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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CHPF2Q9P2E5 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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CHPF2Q9P2E5 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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