Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 CPEB2-AS1-202ENST00000501916 1806 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 LINC01677-204ENST00000635342 1329 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 ACKR2-201ENST00000422265 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 CEP290-207ENST00000552810 7948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 LPA-201ENST00000316300 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 CASR-205ENST00000639785 10047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 MKI67P1-201ENST00000604297 1460 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 KIF1B-203ENST00000377083 5885 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 OAT-208ENST00000539214 1864 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 SLC6A14-202ENST00000598581 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 ZNF350-201ENST00000243644 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 GAPDHP57-201ENST00000424400 585 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 OR4A13P-201ENST00000529316 942 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC084782.2-201ENST00000561934 839 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 UBA2-202ENST00000439527 2802 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AMPD3-209ENST00000529507 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 SLC4A4-204ENST00000425175 7596 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 CXCR6-202ENST00000438735 2242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 JAM3-202ENST00000441717 3363 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC109361.1-201ENST00000513220 3526 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC022075.1-201ENST00000500682 2830 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC015871.3-201ENST00000618835 2261 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC019178.1-201ENST00000392337 440 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AL589740.1-201ENST00000457513 756 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms