Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 MRAP-202ENST00000339944 440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 SOX9-AS1-202ENST00000414600 742 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AL034345.2-202ENST00000416948 830 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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SYNE4Q8N205 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
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SYNE4Q8N205 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SYNE4Q8N205 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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