Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC096708.2-201ENST00000577676 512 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 CSNK1A1-210ENST00000606719 835 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AP005212.3-201ENST00000619964 528 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 C7orf31-202ENST00000409280 3357 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 RAD51AP2-201ENST00000399080 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 NBPF14-201ENST00000581201 2931 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 ZNF189-202ENST00000339664 3021 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 NEXN-202ENST00000334785 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC022150.4-201ENST00000598322 2848 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 NPIPB13-201ENST00000520915 3584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 RALBP1-206ENST00000609094 3676 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 PSMD5-AS1-213ENST00000640327 3531 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 ADAM3A-205ENST00000481351 2379 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 IGHV4-59-201ENST00000390629 495 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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CCDC85BQ15834 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC005808.1-201ENST00000444112 381 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC079921.2-201ENST00000507579 455 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC022296.2-201ENST00000512424 202 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 IGKV3D-31-201ENST00000519131 281 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 ST13P6-201ENST00000522430 1102 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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CCDC85BQ15834 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 MT1B-202ENST00000562399 351 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 RN7SL178P-201ENST00000582930 304 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AL353626.1-201ENST00000613429 507 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 TMEM135-201ENST00000305494 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 PIRT-201ENST00000580256 3810 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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