Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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