Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
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CNGB1Q14028 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC7.94□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
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CNGB1Q14028 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
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CNGB1Q14028 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
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CNGB1Q14028 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
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CNGB1Q14028 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
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CNGB1Q14028 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
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