Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SP140Q13342 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SP140Q13342 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SP140Q13342 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SP140Q13342 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SP140Q13342 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SP140Q13342 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SP140Q13342 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SP140Q13342 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SP140Q13342 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SP140Q13342 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
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SP140Q13342 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SP140Q13342 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SP140Q13342 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
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SP140Q13342 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
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SP140Q13342 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SP140Q13342 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
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SP140Q13342 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SP140Q13342 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
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SP140Q13342 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
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SP140Q13342 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SP140Q13342 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SP140Q13342 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SP140Q13342 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
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SP140Q13342 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
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SP140Q13342 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
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SP140Q13342 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
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