Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 Metazoa_SRP.106-201ENST00000622471 296 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AL450990.1-201ENST00000632868 582 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 BDNF-AS-201ENST00000499008 2324 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AL450327.1-201ENST00000430931 2632 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 SMG1P4-203ENST00000517529 1589 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 MAPK10-251ENST00000640858 3052 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 WDR93-204ENST00000558000 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 CLNK-204ENST00000515667 4180 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 TMCO5A-205ENST00000559502 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC099796.1-201ENST00000433377 683 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 PGBD4P1-201ENST00000473644 407 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC012158.1-202ENST00000482431 1132 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 LINC02059-201ENST00000503843 452 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AL162632.2-201ENST00000553933 399 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AL161757.4-202ENST00000557467 737 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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