Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC020611.2-201ENST00000535594 671 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 CD96-201ENST00000283285 4324 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.7 ms