Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPS29P62273 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPS29P62273 LINC01197-205ENST00000614853 1774 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPS29P62273 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPS29P62273 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPS29P62273 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPS29P62273 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPS29P62273 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPS29P62273 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPS29P62273 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPS29P62273 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPS29P62273 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPS29P62273 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPS29P62273 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPS29P62273 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPS29P62273 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPS29P62273 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPS29P62273 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPS29P62273 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPS29P62273 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPS29P62273 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPS29P62273 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPS29P62273 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPS29P62273 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPS29P62273 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPS29P62273 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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