Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms