Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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