Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AL162427.1-201ENST00000450399 439 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AP000662.1-201ENST00000530952 487 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms