Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC8.8□□□□□ -1
PTPRGP23470 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PTPRGP23470 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
PTPRGP23470 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC8.8□□□□□ -1
PTPRGP23470 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC8.8□□□□□ -1
PTPRGP23470 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC8.8□□□□□ -1
PTPRGP23470 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
PTPRGP23470 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
PTPRGP23470 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC8.8□□□□□ -1
PTPRGP23470 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
PTPRGP23470 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC8.8□□□□□ -1
PTPRGP23470 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC8.8□□□□□ -1
PTPRGP23470 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRGP23470 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRGP23470 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRGP23470 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRGP23470 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRGP23470 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRGP23470 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC8.79□□□□□ -1
PTPRGP23470 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRGP23470 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRGP23470 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRGP23470 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRGP23470 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRGP23470 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC8.79□□□□□ -1
PTPRGP23470 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRGP23470 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC8.79□□□□□ -1
PTPRGP23470 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC8.79□□□□□ -1
PTPRGP23470 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRGP23470 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRGP23470 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRGP23470 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRGP23470 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC8.79□□□□□ -1
PTPRGP23470 LINC00483-203ENST00000450727 686 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRGP23470 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC8.79□□□□□ -1
PTPRGP23470 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRGP23470 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRGP23470 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRGP23470 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRGP23470 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRGP23470 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRGP23470 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRGP23470 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC8.79□□□□□ -1
PTPRGP23470 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRGP23470 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRGP23470 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRGP23470 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC8.78□□□□□ -1
PTPRGP23470 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
PTPRGP23470 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
PTPRGP23470 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
PTPRGP23470 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
PTPRGP23470 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC8.78□□□□□ -1
PTPRGP23470 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
PTPRGP23470 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
PTPRGP23470 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
PTPRGP23470 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC8.78□□□□□ -1
PTPRGP23470 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
PTPRGP23470 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
PTPRGP23470 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
PTPRGP23470 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC8.78□□□□□ -1
PTPRGP23470 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC8.78□□□□□ -1
PTPRGP23470 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
PTPRGP23470 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
PTPRGP23470 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
PTPRGP23470 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC8.78□□□□□ -1
PTPRGP23470 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC8.78□□□□□ -1
PTPRGP23470 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
PTPRGP23470 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC8.78□□□□□ -1
PTPRGP23470 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
PTPRGP23470 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC8.77□□□□□ -1
PTPRGP23470 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1
PTPRGP23470 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
PTPRGP23470 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 AC009831.5-201ENST00000624000 3189 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 MROH9-201ENST00000367758 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms