Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN9O95484 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
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