Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 AL357153.1-201ENST00000500016 2941 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 CPEB2-AS1-202ENST00000501916 1806 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.1 ms