Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms