Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Syf2Q9D198 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syf2Q9D198 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms