Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg12Q9CQY1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms