Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS2Q9BXC9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms