Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP3Q9BWW4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP3Q9BWW4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP3Q9BWW4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP3Q9BWW4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP3Q9BWW4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP3Q9BWW4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP3Q9BWW4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP3Q9BWW4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP3Q9BWW4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP3Q9BWW4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP3Q9BWW4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SSBP3Q9BWW4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSBP3Q9BWW4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms