Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms