Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNRQ92752 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TNRQ92752 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNRQ92752 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNRQ92752 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNRQ92752 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNRQ92752 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNRQ92752 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNRQ92752 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNRQ92752 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNRQ92752 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNRQ92752 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNRQ92752 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNRQ92752 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNRQ92752 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TNRQ92752 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNRQ92752 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNRQ92752 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNRQ92752 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNRQ92752 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TNRQ92752 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNRQ92752 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNRQ92752 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TNRQ92752 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNRQ92752 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNRQ92752 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNRQ92752 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNRQ92752 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNRQ92752 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNRQ92752 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TNRQ92752 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNRQ92752 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNRQ92752 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNRQ92752 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNRQ92752 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNRQ92752 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNRQ92752 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TNRQ92752 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNRQ92752 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNRQ92752 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNRQ92752 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNRQ92752 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNRQ92752 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNRQ92752 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNRQ92752 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNRQ92752 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNRQ92752 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNRQ92752 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNRQ92752 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNRQ92752 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNRQ92752 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNRQ92752 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNRQ92752 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNRQ92752 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNRQ92752 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNRQ92752 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNRQ92752 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNRQ92752 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TNRQ92752 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNRQ92752 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNRQ92752 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNRQ92752 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNRQ92752 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNRQ92752 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNRQ92752 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNRQ92752 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TNRQ92752 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNRQ92752 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNRQ92752 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TNRQ92752 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNRQ92752 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNRQ92752 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNRQ92752 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNRQ92752 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TNRQ92752 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNRQ92752 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNRQ92752 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TNRQ92752 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNRQ92752 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNRQ92752 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNRQ92752 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNRQ92752 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNRQ92752 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNRQ92752 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TNRQ92752 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNRQ92752 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNRQ92752 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNRQ92752 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNRQ92752 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNRQ92752 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNRQ92752 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNRQ92752 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNRQ92752 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TNRQ92752 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNRQ92752 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TNRQ92752 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNRQ92752 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNRQ92752 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNRQ92752 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNRQ92752 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms