Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DNAAF3Q8N9W5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms